制藥廢水一般成分復雜，污染物濃度高，含有大量有毒有害物質、生物抑制劑(包括一定濃度的抗生素)、難降解物質等。有顏色和氣味，懸浮物含量高，且易產生泡沫等。如果生物制藥發(fā)酵產生的工業(yè)廢水未經處理直接排入河流，將嚴重破壞水體生態(tài)環(huán)境。

生物制藥產生的工業(yè)廢水中含有難降解有機物和有毒化合物，處理難度較大。因此，通常采用物理化學方法進行預處理。由于廢水中SS濃度較高，在生化處理前加入混凝沉淀處理。廢水在進入沉淀池進行固液分離前，先通過細格柵去除懸浮物，然后進入調節(jié)池平衡水質水量，再泵入混凝反應池，再加入適量混凝劑攪拌至形成絮體。然后進行其他相應的處理。

混凝處理是在水中加入凝結劑，通過凝結劑水解或縮聚形成的聚合物的強吸附和架橋作用，使膠體顆粒被吸附結合，或者通過凝結劑的水解產物壓縮膠體顆粒的擴散層，從而達到膠體顆粒不穩(wěn)定和相互凝聚的目的。各種廢水都是由水和均勻分布在水中的細顆粒組成的分散體系。根據顆粒的大小，分散體系可分為三類：粒徑小于1納米的真溶液、粒徑為1 ~ 100納米的膠體溶液和粒徑大于100納米的懸浮液。因為溶液中的顆粒體積小，不會造成光散射，水是透明的。膠體溶液和懸浮液中的顆粒會散射光，水是渾濁的。通常，膠體溶液和部分懸浮液(粒徑小于100 m)通過混凝處理。

對于小諾霉素等抗生素廢水，從發(fā)酵過程可知，LMN鳥氨酸脫羧酶和米黑根霉脂肪酶RML大部分是培養(yǎng)基成分，即葡萄糖、淀粉、蛋白胨、魚粉、玉米粉等。這些成分主要以膠體形式存在。投加硫酸亞鐵等混凝劑后，系統(tǒng)中可形成三價鐵，從而改善絮體的沉降性能，激活廢水中降解微生物的某些酶的活性。加入的硫酸亞鐵還可以與廢水中的有機硫化物形成鐵鹽沉淀，特別是硫醇化合物進行脫除。